天台乌药基因组研究新突破
- 作者：乌药公司 葛君霞
- 来源：
- 发布时间：2025-05-23 08:31
- 访问量：
【概要描述】
4月3日，浙江红石梁集团天台山乌药有限公司联合台州学院，在国际知名SCI期刊《Scientific Data》（影响因子5.8）发表了题为Chromosome-level genome assembly of the traditional medicinal plant Lindera aggregata的学术论文，这项突破性研究为道地药材乌药的深度开发注入“基因密码”。
研究团队综合PacBio HiFi、Illumina、Hi-C以及RNA-seq测序技术对乌药基因组进行了组装和注释。最终，成功获得了一个1.59 Gb的高质量基因组，成功挂载到12条染色体上，组装完整度达到了93.07%。在这个基因组中，重复序列的占比为70.02%，其中长末端重复序列（LTRs）占据了最大比例，这可能是该物种基因组较大的主要原因。同时，研究人员还预测出33,283个基因，其中96.95%的基因被赋予了潜在功能。
在系统发育研究方面，团队基于单拷贝直系同源基因对乌药的系统发育进行了探究，观察到乌药与黑壳楠具有最近的亲缘关系，并且推算出它们大约在23.05百万年前（Myb）产生分化。进一步对该属植物的基因家族扩张/收缩进行了检测，分别鉴定到101个和64个显著扩张和收缩的基因家族。随后，通过KEGG和GO数据库对这些基因家族进行功能富集分析，结果显示它们主要聚集在萜类合成的生物代谢途径中。
高质量乌药参考基因组的获取，意义非凡。一方面，对于提升乌药资源的利用价值起着关键作用，为后续开发更有效的乌药产品提供了坚实基础；另一方面，对于研究樟科植物的系统发育而言，它宛如一座明亮的灯塔，照亮了探索的道路。此外，这一成果还将大力推动乌药药用活性成分合成途径和药理作用机制在分子水平的研究，为分子辅助育种提供强有力的支持，有助于培育出品质更优、产量更高的乌药品种。
值得一提的是，这并非课题组在乌药研究领域的首次亮相。此次是他们在乌药叶绿体基因组(doi.org/10.3390/genes15030263)、线粒体基因组(doi: 10.3389/fpls.2024.1439245)研究后的又一重大突破，是乌药研究征程上的又一座里程碑。
扫二维码用手机看
